东京峰会召开在即,为了确保会议顺利进行,日本警方出动约两万名警力对位于东京湾的超大设施“海洋边缘”进行安保工作。可就在严密的防控下,此地已然发生了爆炸案。令柯南(高山南 配音)等人始料未及的是,现场难道留下了对毛利小五郎(小山力也 配音)极其不利的证据。在此之后,小五郎 遭到逮捕。柯南则发觉安室透曾出现在爆炸现场,同时负了伤。为了还毛利叔叔的清白,柯南和阿笠博士以及青年侦探团的小伙伴们联合起来勘察现场,搜集证据。随着调查的深入,柯南发觉这起爆炸案隐藏着包括恐惧分子、公安在内多方的复杂关系,而真相更令所有人瞠目结舌……